Microsatellite gene diversity analysis in anadromous arctic char, Salvelinus alpinus, from Labrador, Canada

We analysed six loci among 257 Arctic char (Salvelinus alpinus) representing seven locations in Labrador and Newfoundland to provide a first assessment of microsatellites gene diversity in anadromous char and to determine the geographic scale of population structuring within the species. The number of alleles per locus varied between 9 and 48, and gene diversity ranged from 0.190 to 0.968. Significant FST and differences in allele frequencies were observed among most samples, as well as heterozygous deficiency, which was indicative of a Wahlund’s effect. These results implied the existence of genetically distinct populations on a microgeographic scale (less than 10 km) and that our samples represented an admixture of char from those populations that interchange among rivers for owerwintering, in congruence with tagging investigations. These results indicate that microsatellites potentially offer more sensitivity than allozymes and mitochondrial DNA to infer fine-scale population structure in anadromous arctic char. Résumé : Nous avons analysé six loci parmi 257 ombles chevalier (Salvelinus alpinus) provenant de sept sites au Labrador et à Terre-Neuve dans le but d’établir l’utilité des microsatellites pour la quantification du partage de variance génétique parmi les populations anadromes et pour documenter l’échelle de structuration génétique chez cette espèce. Les microsatellites se sont révélés modérément à hautement variables, avec un nombre d’allèles par locus variant entre 9 et 48 et une hétérozygotie attendue variant entre 0.190 et 0.968. Des valeurs de FST significatives, de même qu’une hétérogénéité des fréquences alléliques ont été observées entre la plupart des échantillons. Nous avons observé un déficit en hétérozygote associé à un effet Wahlund dans tous les échantillons, sauf un. Ces résultats traduisent l’existence de populations génétiquement différenciées sur une échelle microgéographique (inférieure à 10 km), de même qu’un mélange de ces populations dans les tributaires d’hivernage, corroborant ainsi les études de marquage. Nous concluons que les microsatellites offre une sensibilité supérieure aux marqueurs traditionnels pour l’étude de structures populationelles fines.